Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR1BP42025 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms