Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms