Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLD1P28340 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLD1P28340 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLD1P28340 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLD1P28340 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLD1P28340 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLD1P28340 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLD1P28340 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLD1P28340 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms