Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXP28300 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXP28300 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXP28300 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXP28300 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXP28300 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXP28300 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXP28300 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXP28300 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXP28300 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXP28300 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXP28300 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXP28300 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXP28300 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXP28300 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXP28300 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms