Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms