Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSSP25774 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSSP25774 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms