Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms