Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL3P19876 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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