Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPEP16870 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPEP16870 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPEP16870 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPEP16870 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPEP16870 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPEP16870 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPEP16870 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CPEP16870 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPEP16870 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CPEP16870 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CPEP16870 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CPEP16870 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms