Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CREB1P16220 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms