Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPBP14678 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms