Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms