Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms