Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
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