Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLUP10909 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLUP10909 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLUP10909 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLUP10909 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLUP10909 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLUP10909 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLUP10909 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLUP10909 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLUP10909 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLUP10909 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLUP10909 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLUP10909 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLUP10909 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLUP10909 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLUP10909 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLUP10909 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLUP10909 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLUP10909 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLUP10909 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLUP10909 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLUP10909 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLUP10909 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLUP10909 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLUP10909 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms