Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD1P0DJD0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms