Protein–RNA interactions for Protein: P04234

CD3D, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3DP04234 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD3DP04234 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD3DP04234 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD3DP04234 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD3DP04234 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD3DP04234 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD3DP04234 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD3DP04234 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD3DP04234 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD3DP04234 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD3DP04234 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD3DP04234 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD3DP04234 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD3DP04234 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD3DP04234 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD3DP04234 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD3DP04234 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD3DP04234 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD3DP04234 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD3DP04234 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD3DP04234 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD3DP04234 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD3DP04234 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms