Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA1P02647 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms