Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP3O75154 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms