Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDSO60760 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms