Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIAA0556O60303 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms