Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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