Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms