Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIAH2O43255 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms