Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP9YO00507 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP9YO00507 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP9YO00507 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9YO00507 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms