Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms