Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E9PCH4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E9PCH4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
E9PCH4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
E9PCH4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
E9PCH4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
E9PCH4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E9PCH4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E9PCH4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E9PCH4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E9PCH4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E9PCH4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E9PCH4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E9PCH4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E9PCH4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
E9PCH4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
E9PCH4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E9PCH4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E9PCH4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
E9PCH4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E9PCH4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E9PCH4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E9PCH4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E9PCH4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E9PCH4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
E9PCH4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E9PCH4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E9PCH4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms