Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms