Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM1B2RUZ4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms