Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms