Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L4A6NEF3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms