Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD3L3A6NE82 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms