Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN6Q9Y6Q1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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