Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9Y3F1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9Y3F1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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