Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms