Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMED5Q9Y3A6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms