Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms