Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms