Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFMBT1Q9UHJ3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms