Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMD4AQ9P2Q2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms