Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms