Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms