Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHDC1Q9NTX5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC1Q9NTX5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms