Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms