Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms