Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms