Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP29Q9HBJ7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP29Q9HBJ7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP29Q9HBJ7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP29Q9HBJ7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP29Q9HBJ7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP29Q9HBJ7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP29Q9HBJ7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms