Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms