Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZYG11BQ9C0D3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms