Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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